Forskere fra Baylor College of Medicine i USA har vist, at hyppigt kaffeforbrug fører til et fald i risikoen for at udvikle hjerte-kar-sygdomme, diabetes og leverdysfunktioner. En oversigt over forskningen er tilgængelig på webstedet American College of Gastroenterology.
Undersøgelsen involverede 34 personer, der gennemgik en screeningskoloskopi og ikke havde patologiske ændringer i tyktarmen. Frivillige udfyldte et spørgeskema, der angav hyppigheden af kaffeforbruget. Eksperter tog 97 prøver af slimhinden fra forskellige segmenter af patienternes tarme og isolerede DNA fra mikroorganismer, der udgør mikrofloraen. Derefter blev DNA'et, der koder for 16S ribosomalt RNA, udvidet under amplificeringsprocessen, dvs. yderligere kopier af de isolerede gener blev skabt, hvilket letter deres identifikation.
Forskere har fastlagt nukleotidsekvensen af DNA og bestemmer deres tilhørighed til forskellige grupper af bakterier. De sammenlignede derefter den mikrobielle mangfoldighed og hyppighed af taxa ved højt (større end 82,9 milligram pr. Dag) og lavt (mindre end 82,9 milligram) koffeinindtag.
Det viste sig, at de, der drak en masse kaffe, havde større alfa-mangfoldighed, dvs. mangfoldigheden inden for mikrobielle samfund end resten. Grupperne af mikroorganismer i kaffedrikkere var også signifikant forskellige fra dem, der levede i tarmen hos deltagere, der spiste lidt koffein. Antallet af faecalibacterium og roseburia, der har antiinflammatoriske virkninger, steg, mens det potentielt skadelige Erysipelatoclostridium og Lachnospiraceae faldt. Dette forhold blev observeret uanset alder og ernæringskvalitet.
16S ribosomalt RNA (16S rRNA) er en af hovedkomponenterne i ribosomer (syntetiserende proteiner fra celleorganeller) i bakterier og archaea. Generene, der koder for 16S rRNA, anvendes i fylogenetik til at bestemme de evolutionære forhold mellem forskellige grupper af mikroorganismer på grund af den lave udviklingshastighed i denne DNA-region. I øjeblikket oprettes databaser, der indeholder information om mikrober, der indeholder en eller en anden variant af 16S rRNA-genet.