Tailless DNA-holdige bakteriofager kunne ikke påvises ved standardmetoder - men nu mener forskere, at de dominerer verdens oceaner.
Hver dråbe vand ikke for dybt fra havoverfladen indeholder ca. 10 millioner vira. Det er næppe overraskende, at biologer konstant opdager nye, selvom opdagelsen af en helt ny gruppe stadig er meget sjælden. Det ser ud til, at standardteknikker simpelthen ikke gjorde det muligt at bemærke dem, selvom sådanne vira viste sig at være ekstremt mange - måske er de ikke kun udbredt i havet og simpelthen undgåede forskere.
Martin Polz fra Massachusetts Institute of Technology og hans kolleger undersøgte vandprøver taget ud for den nordamerikanske kyst ved Atlanterhavet. De kiggede efter vira indeholdende dobbeltstrenget DNA - sådanne vira er ekstremt udbredt, inklusive herpes, og bakteriofagen T4 (Caudovirales), som alle kender fra skolen. Efter at have inficeret kulturer af marine bakterier Vibrionaceae, opdagede forskere 200 forskellige DNA-vira, hvoraf 18 blev henført til den nye orden Autolykiviridae. De skriver om dette i en artikel offentliggjort i tidsskriftet Nature.
Gruppens navn henviser til helten fra den græske mytologi Autolycus, en listig tyv, der er lige så vanskeligt at fange som disse vira. "De mest almindelige vira på Jorden er bakterieinficerende vira, der indeholder dobbeltstrenget DNA," skriver Poltz og hans medforfattere.”Caudovirales med halefyrede vira, der dominerer databaser og samlinger af afgrøder, er imidlertid ikke repræsentative for deres tilstedeværelse i miljøet. Faktisk dominerer spidsfri vira vandprøverne."
Bakterieceller inficeret med Autolykiviridae / MIT Phages, Kauffman et al., 2018.
"Tailless" -bakteriofager Autolykiviridae er kendetegnet ved en lille genomstørrelse - kun ca. 10 tusind baser, 4-5 gange mindre end hos "halet" pårørende. Deres evne til at inficere og dræbe bakterieceller var også usædvanlig. Hvis almindelige fager i eksperimenter som regel påvirkede en bestemt arter af vibrios, inficerede disse i gennemsnit fire og førte til en markant højere celledød. "Det blev fundet, at de var ansvarlige for 40 procent af bakteriedødsfaldene, selvom de tegnede sig for ca. 10 procent af det samlede antal vira i prøven," forklarer en af forfatterne af værket.
Vibriobakterier af forskellige arter er placeret langs omkretsen af diagrammet; cirklerne af vira, der inficerer dem, er forbundet med dem: blå - "halede" bakteriofager, orange - "spidsfri" Autolykiviridae / MIT, Kauffman et al., 2018.
Disse tal viser den store rolle, som den nye gruppe Autolykiviridae spiller i reguleringen af bakteriepopulationer og i biosfæren som helhed. Videnskabsmænd er overbeviste om, at deres teknik vil hjælpe med at finde vira, der tidligere er undgået detektion i jorden og muligvis i den menneskelige tarme. Lignende genetiske sekvenser findes faktisk i genomerne af bakterier i den menneskelige mikroflora.
Salgsfremmende video:
Sergey Vasiliev