Deltagere i genomet 10K-konsortiet på den årlige konference, som nu finder sted i New York, annoncerede lanceringen af det internationale projekt "Vertebrate Genomes", dets opgave er at samle genomerne til alle 66 tusind hvirveldyrarter, der lever på planeten i dag. Gizmodo fortæller mere om projektets mål og mål.
I 2009 grundlagde amerikanske biologer David Haussler, Oliver Ryder og Stephen O'Brien genomet 10K-projektet, hvis mål var at sekvensere 10.000 hvirveldyrsgenomer. Oprindeligt deltog 55 forskere fra store zoologiske haver, forskningscentre og museer i projektet. Først var det ikke klart, hvor lang tid det ville tage at samle genomer af tilstrækkelig kvalitet. Men med reduktionen i omkostningerne og forenklingen af sekventeringsmetoder blev det klart, at projektet ville fuldføre sine opgaver om få år. I løbet af de sidste tre år har projektdeltagerne sammenlignet de vigtigste teknologier til DNA-sekventering og analyse af de opnåede resultater for at vælge den, der vil skabe "platin-genomer".
I går annoncerede medlemmer af Genome 10K lanceringen af et nyt projekt til hvirvelløse genomer, der sigter mod at samle de mandlige og kvindelige genomer på 66.000 hvirveldyrarter. Projektet vil involvere 150 forskere, der repræsenterer 50 organisationer fra 12 lande. Ifølge en af grundlæggerne af projektet, Oliver Ryder, vil biologer som et resultat være i stand til at forstå årsagerne til udryddelsen af arter, herunder om der har været nært beslægtede krydsninger i artenes historie, "flaskehalse", som et resultat af, at artenes genetiske mangfoldighed er faldet eller sletninger - mutationer, der kan "slukke »Gener, der er nødvendige for organismenes overlevelse.
Sammen med meddelelsen om det nye projekt præsenterede forskere straks de første resultater af sit arbejde: genomerne fra 15 arter af hvirveldyr, herunder den truede kakapo ugle papegøje, endemisk til New Zealand og den australske platypus. Disse og alle andre genomer, som forskerne planlægger at indsamle, vil blive offentliggjort i det offentlige domæne i Noahs Ark Genomiske database.
Deltagerne planlægger at sekvensere korte sektioner af genomisk DNA og samle fra dem stadig længere sekvenser op til hele kromosomet og derefter "lim" dem ved hjælp af algoritmer, der er specielt udviklet til projektet.
Tidligere var forskere i stand til at læse en persons genom på en smartphone-størrelse lomme sequencer. Enheden satte rekorden for den længste aflæsning af et DNA-molekyle, det var i stand til at sekvensere sekvenser på op til 882 tusind basepar.
Ekaterina Rusakova
