Genetikere har afkodet genomet til pesten bacillus, en bakterie, der ødelagde Europa i det 14. århundrede. Det viste sig, at den dødbringende pestestok næsten ikke kan skelnes fra dens ufarlige “oldemor”
I august 2011 fik forskere fra universiteter i USA, Tyskland og Canada, ledet af Johannes Krause fra University of Tuebingen, de første delvise data om DNA fra pesten bacillus Yersinia pestis, der dræbte 30 millioner mennesker i en femårs periode i det 14. århundrede. … For at gøre dette undersøgte genetikere knogler og tænder fra pestofre begravet i 1348 på Londons East Smithfield Cemetery.
I et papir fra august genvindte forskere cirkulært DNA, der er placeret uden for kromosomerne og er nødvendigt af bakterier til at syntetisere proteiner, der undertrykker menneskets immunitet. Denne DNA - plasmid pPCP1 - biologer sammenlignet med lignende dele af genomet i moderne pestestokke, hvorefter de kom til den konklusion, at pestbacillus i det 14. århundrede døde ud og efterlod ingen efterkommere.
I den seneste undersøgelse, hvis resultater blev vist i Nature, anvendte Dr. Krause og hans kolleger en allerede etableret teknik til at samle det komplette genom af Yersinia pestis.
De valgte flere velbevarede tænder fra East Smithfield-grave. Resterne af bakteriegenomet blev fundet på tændernes kroner og rødder. Puslespillet med fire millioner nukleotider af genetik blev samlet ved hjælp af et computerprogram.
Som forskerne bemærker, er nøjagtigheden af afkodning af Yersinia pestis genomet høj - sammenlignelig med nøjagtigheden af at afkode det menneskelige genom.
Sandt nok, i genomet til den dødbringende bakterie er der stadig hvide pletter: biologer har gendannet 93,5% af det genetiske "puslespil" - de resterende dele er opløst i massegraven i East Smithfield.
Bedstemor til den sorte død
Dr. Krauses team sammenlignede strukturen af det resulterende DNA med genomet til den moderne pestbacillus (stamme CO92). Det viste sig, at de fleste af generne i kromosomer og plasmider falder sammen, men nogle regioner er enten helt fraværende i moderne bakterier eller er erstattet af andre DNA-sekvenser.
Salgsfremmende video:
I genomet til en middelalderlig bakterie har forskere også opdaget gener, der kombinerer de mest gamle stammer af Yersinia pestis med deres fælles stamfar, bakterien Yersinia pseudotuberculosis.
"Dette indikerer, at genomet til Yersinia pestis har ændret sig lidt i løbet af de sidste 600 år, på trods af flere epidemier og aktive personer, der bekæmper patogener," - siger forskere og opsummerer resultaterne af den sammenlignende analyse.
