Forskere har opdaget en familie af unikke korte gentagelser i svinegenomet, der har evolutionære ligheder med lignende gentagelser i primater.
Forskere fra Jilin University (Changchun, Kina) og Academy of Agricultural Sciences (Heilongjiang, Kina) deltog i projektet i samarbejde med Firefly BioWorks Corporation (USA).
Efter at have analyseret strukturen og oprindelsen af PRE-1 (svinegentagelseselement, bogstaveligt talt - "svinegentagende element") kom de til den konklusion, at de nærmeste slægtninge til primater på det tidligere superkontinent Laurasia kunne være svin. Forskningsfortrykket blev offentliggjort på bioRxiv-serveren den 31. august 2015.
Den undersøgte CDP (kortdispergeret gentagelse) PRE-1 er placeret i den intergene region, ca. 686 ~ 985 basepar inden starten af genet, der koder for insulinvækstfaktorbindende protein (IGFBP7). Den gentagne PRE-1-sekvens på 299 basepar blev sammenlignet med 40 forskellige primat-Alu-gentagelser, og der blev fundet signifikante ligheder både i selve sekvenserne og i mønsteret for fordelingen af deres gentagelser på tværs af kromosomer.
Den forudsagte sekundære struktur af RNA gentager PRE-1 foldet til en model svarende til Alu-gentagelserne. Endelig foreslog den fælles oprindelse af PRE-1 og Alu fra den såkaldte 7SL RNA (signalgenkendelses-RNA) deres evolutionære lighed og tilskrev svin til familien, som primært inkluderer primater.
Tidligere, for at bygge fylogenetiske træer, baserede forskere sig kun på ligheder og forskelle mellem gener, idet de ignorerede det faktum, at hele genomet gennemgik ændringer, inklusive dem af dets elementer, der ikke koder for proteiner eller RNA, og hvis betydning stadig stort set er uklar for forskere.
Salgsfremmende video:
Denne undersøgelse, der er baseret på en integreret tilgang til analysen af intergeniske elementer, giver ifølge forfatterne "meget overbevisende" fakta, hvorfra evolutionære konklusioner kan drages. Især ifølge disse resultater skifter den estimerede tid for divergens mellem arter fra 65 til 80-100 millioner år siden.