I begyndelsen af dette århundrede skulle japanske eksperter undersøge DNA'et fra Tutankhamuns mumie for at finde ud af, om han var søn af Amenhotep III. Sammen med den mystiske død af denne måske den mest berømte egyptiske farao vidste historikere ikke nøjagtigt, hvem hans far var. Der var kun gæt, versioner og antagelser. En chance hjalp med at besvare spørgsmålet om oprindelsen af den berømte konge.
I et af de arkæologiske arkiver i det centrale Egypten, hvor mange arkitektoniske fragmenter af Atons templer fra Akhetaton, hovedstaden til reformatoren Farao Akhenaten og hans kone Nefertiti, blev fundet, blev der fundet en kalkstenblok med inskriptioner i slutningen af sidste år.
Ifølge AREs øverste råd for antikviteter skildrer det en ung Tutankhamun, der sidder med sin kone Ankhesenamun (Ankhesenpaaton - "Hun lever for (gud) Aten" - det var navnet på Ankhesenamun i de første år af hans regeringstid). At dømme efter den overlevende tekst, hvor de tidlige, soltilbedende former for parrets navne bruges, præsenteres her "kongens søn fra hans kød, Tutankhaton" og hans kone "kongedatteren fra hans kød, Ankhesenpaaton."
Blokken tilhørte de tidlige strukturer i Akhetaton, efter ødelæggelsen af den under Ramses II blev den brugt sammen med titusinder af lignende fragmenter af tempelvægge til opførelsen af pylon af Thoth-templet i Hermopolis. Hvis blokken tidligere blev brugt i Akhetaton, betyder det, at den eneste konge, der kunne være far til begge ægtefæller, er Akhenaten.”Vi ved fra andre kilder, at Ankhesenamun var datter af Akhenaten og Nefertiti,” siger Zaha Hawass, generalsekretær for det højeste råd for antikviteter. "Nu kan vi med tillid sige, at Tutankhamun også var søn af Akhenaten og giftede sig med sin halvsøster."
Akhenaten, der ifølge nogle eksperter led af Marfans syndrom (en arvelig forstyrrelse i bindevævet med karakteristiske ændringer i bevægeapparatet) og Frolikhs syndrom (en tendens til at være overvægtig), forsøgte at reformere sine landsmænds religion fuldstændigt. Ønsket om at indføre monoteisme (tilbedelse af Aton) i landet tillod Sigmund Freud at kalde Akhenaten (eller Amenhotep IV) forløberen og endda mentoren for profeten Moses. Reformen af den egyptiske kult under Akhenaten provokerede præsterne modstand.
I det 17. år af Akhenatons regeringstid blev en af hans sønner, Smenkhkar, udnævnt til sin medhersker. Akhenaten blev snart væltet og formodentlig blindet. Efter et års regeringstid overgav Smenkhkare kronen til sin yngre bror Tutankhaton, der skiftede navn til Tutankhamun, hvilket indikerer en tilbagevenden til tilbedelsen af guden Amun. Tutankhamun regerede i 10 år og døde i en ung alder.
Spørgsmålet om mor til Tutankhamun forbliver åbent. Den mest realistiske kandidat anses for at være dronning Kiya - en af Akhenatens yngre samværer, sandsynligvis oprindeligt kendt som den mitanniske prinsesse Taduheppa, der endte i den egyptiske domstol som et resultat af et diplomatisk ægteskab. Dronning Kiya døde, sandsynligvis under fødslen. Sarkofagen til begravelse af dronning Kiya blev fundet i 1907 i Kongernes dal. Monumentet med dronning Kiyas ansigt, opbevaret i Berlinmuseet, har en slående lighed med Tutankhamuns udseende.