Forskere har opdaget en ny virus i Brasilien, hvis DNA er 90 procent af gener, der er ukendt for videnskaben. Resultaterne af opdagelsen offentliggøres på bioRxiv-fortrykswebstedet.
Virussen blev påvist i den kunstige sø Pampulha i den brasilianske by Belo Horizonte. Dets ikke særlig komplekse genom består næsten udelukkende af gener, der er ukendt for videnskaben. Forfatterne opkaldte den nye virus Yaravirus brasiliensis efter vandmynyphen Yara fra mytologien fra befolkningen i Sydamerika.
Forskere spekulerer i, at de står over for det første tilfælde af en ukendt isoleret gruppe af vira eller en fjern art af en gigantisk virus, der har udviklet sig til en mindre form.
Opdaget først i det 21. århundrede når kæmpe vira størrelser, der kan sammenlignes med bakteriens celle. De fik deres navn på grund af deres enorme kapsider - proteinmembraner, der indkapsler virioner - virale partikler. De har også et DNA med den passende længde, der overstiger 200 tusind basepar og ofte indeholder de såkaldte forældreløse eller forældreløse gener (ORFan), som ikke findes i nogen anden gruppe organismer.
Komplekse genomer gør det muligt for gigantiske vira at syntetisere proteiner og udfører derfor DNA-reparation, replikation, transkription og translation. Før deres opdagelse blev det antaget, at vira ikke har sådanne evner, da de er inerte væsener, der kun kan inficere deres værter. Alle kendte gigantiske vira er parasitter af amøber.
Og selv om størrelsen på den nye mikroorganisme er væsentligt mindre end kæmpe vira - ca. 80 nanometer - parasiterer den også på amøber, og dens genom er næsten fuldstændigt forældreløst: 68 af dets gener (mere end 90 procent) finder ikke analoger i nogen kendt organisme og kun seks meget vagt, som dem, der er kendt af videnskaben.
”Dette skyldes, at virussen er en ny afstamning af amoebisk virus med forbløffende oprindelse og fylogeni,” sagde en af studielederne, Jônatas Abrahão fra Federal University of Minas Gerais i Brasilien, i en pressemeddelelse.
Forskere har analyseret mere end otte og et halvt tusinde metagenomer, men har ikke fundet vira relateret til den nye mikroorganisme blandt dem. Som andre vira fra denne gruppe er det repræsenteret ved dobbeltstrenget DNA, hvis længde er 44.900 basepar og indeholder 74 kodende fragmenter.
Salgsfremmende video:
"Ved hjælp af standardprotokoller var vores allerførste genetiske analyse ikke i stand til at påvise nogen genkendelige kapsidsekvenser eller andre klassiske virale gener i yaravirus," forklarer Yonatas Abrajao og anden studieleder Bernard La Scola fra Aix-Marseille Universitet i Frankrig.
I henhold til de officielle metagenomiske protokoller kan yaravirus ikke engang anerkendes som et viralt middel, fordi det ikke har nogen klar lighed med dem. Forskere kan endnu ikke sige, hvad han virkelig er - en repræsentant for en helt ny gruppe eller en efterkommer af en gigantisk virus, der på en eller anden måde udviklede sig til en mindre form.
"Antallet af ukendte proteiner, der udgør yaraviruspartiklerne, afspejler den variation, der findes i den virale verden, og hvor mange nye virale genomer, der endnu ikke er opdaget," konkluderer forfatterne.